為貫徹落實黨的教育方針和立德樹人根本任務，切實加強學校心理健康教育工作，2016年云南大學成立心理健康教育中心，面向全校師生開展心理健康教育與咨詢服務。中心設有預約接待大廳、團體輔導室、沙盤游戲室、心理宣泄室、音樂放松室等空間，面積150余平米。心理健康教育中心致力于提升學生心理健康水平，通過開展規范的心理健康教育與咨詢服務，加強人文關懷和心理疏導，關注學生不同的成長需求，引導學生形成自尊自信、理性平和、積極向上的健康心態，培養健全人格，增強適應能力，預防和消除心理障礙，促進學生健康成長與全面發展。

主要工作內容包括:開展全校學生心理健康普查、建立學生心理健康檔案、開展個體及團體心理咨詢、開展心理健康知識查傳和培訓、指導學生心理社團活動等，做好學生心理疾病的預防和疏導工作。